Biochimie - Proteine

structura superioara, spatiala a proteinelor este rezultatul legaturilor stabilite intre catenele laterale ale aminoacizilor componenti.

nivele de organizare: structura secundara, tertiara si cuaternara, nivele ce alcatuiesc conformatia proteinei.

Trecerea la conformatia spatiala se datoreaza tendintei proteinei de a avea ?G minim in conditiile particulare ale mediului in care se afla: pH, tarie ionica, temperatura, solvent.

Conformatia este dependenta de structura primara si este raspunzatoare pentru functia biologica specifica a proteinei.

Orice modificare conformationala va afecta functia biologica specifica a proteinei, acest lucru constituind un aspect important in etiologia a numeroase maladii.

Este o organizare regulata, repetitiva, realizata prin legaturi de hidrogen intre componentele legaturilor peptidice (intre hidrogenul gruparii -NH- si oxigenul gruparii carbonil).

Legaturile pot fi intra sau intercatenare. Unghiurile ? si ? ale legaturilor peptidice vor avea valori egale in toate legaturile peptidice din segmentul cu structura secundara regulata.

Proteinele cu structura secundara prezinta variante sau modele de realizare a structurii:

? - helix

foaie pliata (structura ?)

bucle de legatura (cot ?)

superhelix (colagenic)

spirala cu infasurare spre dreapta, acest tip de infasurare fiind mai stabil.

Confomatia este realizata prin legaturi de hidrogen intre componentele legaturilor peptidice provenind de la un rest de aminoacid si cel de-al patrulea care il urmeaza in catena:

Legaturile de hidrogen sunt paralele cu axul spiralei, iar radicalii resturilor de aminoacizi sunt indreptati catre exterior, proteina intrand in interactie cu solventul.

destabilizat de resturilor de prolina (nu au grupare -NH-), de prezenta radicalilor voluminosi (Val, Ile) sau cu potential de a forma legaturi de hidrogen intre catenele laterale (Ser, Asp).

Modelul ?-helix este comun atat proteinelor fibroase (miozina, tropomiozina, ?-keratina) cat si globulare (globinele din hemoglobina).

?-Keratina - component major al parului, pielii, unghiilor - este constituita aproape in intregime din structuri ?-helix.